Lyginant su pirmosios kartos Fabia, ienterjeras pasikeitė visiškai. Vairuotojui suteikiamas didesnis komfortas ir geresnis prietaisų matomumas dėka nuajo prietaisų skydelio dizaino ir prietaisų valdymo ergonomikos. Galimos dvi interjeros dizaino versijos su trimis skirtingais spalvų deriniais.
Galinių sėdynių keleiviams dabar dar daugiau erdvės – kojoms išilgai ir dėl padidėjusio automobilio, erdvės galvoms. Erdvės pagažui taip pat daugiau. Bagažinės tūris išdidėjo iki 300 litrų, o jei sėdynės yra nulenktos, bagažui Fabia suteiks net 1,163 litrus erdvės.